El Programa SEDCERO viene impulsando lineas de trabajo específicamente orientada a las escuelas rurales. En este sentido, en el año 2014 se realizó una primera convocatoria de proyectos de agua junto a la Fundación Escolares y la Fundación Avina. Se financiaron 6 proyectos escolares.

Al mismo tiempo, se comenzó a planificar con la OEI, la Fundación ESSEN, la Asociación Promotores Chaco, la RedTISA, y la Universidad Nacional de Quilmes, un programa denominado Escuelas Sustentables. Esta línea propuso realizar un abordaje sistémico de los problemas de las escuelas, priorizando el acceso a agua para consumo, sanitarios, y agua para huertas.

Durante el año 2014 y 2016 se realizaron acciones en 14 escuelas.

Asimismo se elaboraron diversos materiales didácticos.